人类与猪的基因类似度没有一个合用于所有场景的固定百分比。。。。。若按“能否找到对应的同源基因”推算，，，，，，，，人和猪通常共享绝大无数可比力基因，，，，，，，，常见概括为九成以上的基因拥有对应关系；；；；；；；若按DNA逐个碱基比对，，，，，，，，了局会显著低于这个数字。。。。。两种数据都能够称为“类似度”，，，，，，，，但推算对象、公式和合用领域并不一样。。。。。

因而，，，，，，，，不能把“人和猪共享九成以上基因”直接理解为“人和猪全基因组有九成以上的DNA碱基齐全一样”。。。。。前者描述基因是否存在对应物，，，，，，，，后者描述对应序列中的每个地位是否一致。。。。。

人类与猪的基因类似度，，，，，，，，首先要明确推算对象

现实汇报中，，，，，，，，最常被混合的是共享基因率和DNA序列一致性。。。。。共享基因率只有确认两个物种存在同源关系，，，，，，，，就能够计入；；；；；；；序列一致性则要求把相应区域分列后逐位比力。。。。。一个基因即便在两个物种中都存在，，，，，，，，内部的碱基分列依然可能有不少差距。。。。。

共享基因率若何推算

若是以人类基因集为参考，，，，，，，，公式能够写成：

人类参考口径的共享基因率 = 人猪同源基因对数量 ÷ 人类参加统计的基因数量 × 100%

若是改用猪的基因集作为分母，，，，，，，，了局可能分歧：

猪参考口径的共享基因率 = 人猪同源基因对数量 ÷ 猪参加统计的基因数量 × 100%

这是由于人和猪的基因注解数量、基因家族划分以及一对多基因关系并不齐全一样。。。。。为了削减分母选择造成的影响，，，，，，，，也能够使用并集口径：

对称共享率 = 共同同源基因数 ÷（人类基因数 + 猪基因数 ? 共同同源基因数）× 100%

例如，，，，，，，，某一份数据中有19,000幼我类基因，，，，，，，，其中18,000个能找到猪的同源基因，，，，，，，，那么按人类作为参考的共享基因率为18,000 ÷ 19,000 × 100%，，，，，，，，约为94.7%。。。。。这只是推算示例，，，，，，，，不代表所罕见据库或所有基因类别城市得到这个数值。。。。。

在真实钻研中，，，，，，，，通；；；；；；；嵯认拊焱臣贫韵，，，，，，，，例如只统计蛋白编码基因，，，，，，，，或者只统计一对一起源基因。。。。。数据库版本、基因注解更新、是否纳入非编码RNA、是否排除低质量预测基因，，，，，，，，城市扭转最终百分比。。。。。因而，，，，，，，，“九成以上”适合作为基因层面的概括，，，，，，，，不宜当作唯一精确值。。。。。

DNA序列一致性为什么会低于共享基因率

DNA序列一致性针对的是已经对应的序列，，，，，，，，而不是基因名称是否一样。。。。。常用公式为：

DNA序列一致性 = 比对区域中一样碱基的数量 ÷ 参加比力的碱基地位数量 × 100%

例如，，，，，，，，两段同源DNA经过比对后有1,000,000个可比力地位，，，，，，，，其中820,000个地位的碱基一样，，，，，，，，那么序列一致性就是82%。。。。。若是插入、缺失地位被计入差距，，，，，，，，或者只统计无缺口地位，，，，，，，，了局也会有所分歧，，，，，，，，所以正式数据必须注明缺口处置方式。。。。。

对人和猪而言，，，，，，，，若只比力彼此可能对应的蛋白编码区，，，，，，，，序列一致性通；；；；；；；岽υ约80%到90%这一量级，，，，，，，，但具体数值不能脱离数据集单独确定。。。。。比力DNA编码序劣注氨基酸序劣注启动子区域或整条染色体，，，，，，，，所得了局并不一样。。。。。蛋白质序列有时会比DNA序列看起来更类似，，，，，，，，这是由于遗传密码拥有冗余性，，，，，，，，一些DNA碱基变动并不会扭转所编码的氨基酸。。。。。

全基因组直接比力还会受到沉复序劣注大片段插入缺失、染色体结构差距以及尚未实现注解区域的影响。。。。。此时必要同时汇报“比对覆盖率”和“覆盖区域内的一致性”，，，，，，，，不能只给出一个百分比。。。。。

“共同基因”不蹬宗“职能齐全一样”

同源基因暗示两个物种的基因来自共同的祖先基因，，，，，，，，或者在进化过程中维持了可识此外对应关系。。。。。它注明两者拥有进化联系，，，，，，，，并不料味着基因的调控方式、表白功夫和生理作用齐全一样。。。。。

人和猪的很多基因参加类似的根基性命过程，，，，，，，，例如细胞代谢、免疫反映、组织发育和激素调节。。。。。但统一个基因可能在分歧组织中的表白量分歧，，，，，，，，调控序列也可能分歧；；；；；；；基因拷贝增长或削减后，，，，，，，，职能还可能产生分化。。。。。因而，，，，，，，，基因层面的高类似度能够支持比力钻研，，，，，，，，却不能直接推导出两种动物在所有性状、疾病反映或药物反映上齐全一致。。。。。

还要分辨同源基因、旁系同源基因和嫡系同源基因。。。。。人类和猪之间的一对一嫡系同源基因最适合用于不变比力；；；；；；；若是一个物种中出现多个有关拷贝，，，，，，，，直接把它们全数算作一个“一样基因”，，，，，，，，可能会高估共享水平。。。。。

怎么给出严谨的人猪基因类似度结论

若是问题只有求通常性相识，，，，，，，，能够表述为：人类和猪在基因层面共享绝大无数同源基因，，，，，，，，常见统计口径可达到九成以上；；；；；；；但这不代表两者全基因组DNA有九成以上碱基齐全一样。。。。。

若是必要用于汇报、论文或数据分析，，，，，，，，应至少注明四项信息：第一，，，，，，，，比力的是基因数量、DNA碱基还是蛋白质序列；；；；；；；第二，，，，，，，，参考基因集和数据库版本；；；；；；；第三，，，，，，，，选取人类、猪还是并集作为分母；；；；；；；第四，，，，，，，，序列比对时若何处置缺口、沉复区域和一对多同源关系。。。。。

简而言之，，，，，，，，“人类与猪的基因类似度”应先确定比力单元，，，，，，，，再选择统计公式。。。。。共享基因率适合回覆“两个物种有几多基因可能对应”，，，，，，，，序列一致性适合回覆“对应基因的分列有几多地位一样”，，，，，，，，而基因组覆盖率则回覆“有几多区域可能进行比力”。。。。。只有把这几个概想分隔，，，，，，，，百分比才拥有明确寓意。。。。。